COVID-19病患的平庸可以从无症状携带、轻症到需要呼吸机甚至体外膜肺氧合(ECMO)维持新生命的危重症病患,这其中的关键因素决定性因素仍然有待破解。同时,新型冠状传染病病毒是否是在传播者过程中引发明显的基因突变,导致传染病病毒毒力和传染性的改变,也迫切促使分析。
自禽流感爆发后来,武汉大学除此以外武汉市公共卫生临床外围(以下全称公卫外围)与转化药学国家相当程度信息技术基础基础设施(武汉)(以下全称基础设施)、武汉血液学分析所、药学基因核酸学国家重点项目Laboratory、瑞金医院临床传染病病毒学Laboratory,武汉大学武汉药学院大分子传染病病毒Laboratory、武汉交通大学药学院除此以外同仁医院、中科院木本植物认知生态分析所、武汉阿佩尔分析所和武汉营养与生活品质分析所等单位四人,就新型冠状传染病病毒基因核酸、大分子毒理学在结构上、传染病临床特点开展了有系统。
5同月20日,《Nature》杂志发表了这一团队的最新分析结果。值得注意,公卫生外围卢洪洲分析员与基础设施主任陈赛娟博士生领衔的联合攻关团队,收集了公卫外围在2020年1同月20日-2同月25日之前收治的326唯病患标本,对传染病病毒基因核酸表征、临床平庸在结构上和免疫反应改变等原始数据开展了全面深度数据分析。
分析团队不断改进技术方法,高质量收尾了112唯新冠传染病病毒基因核酸测序、组装和解析。他们基于传染病病毒基因核酸核酸的进化树数据分析找到,新冠传染病病毒主要有两个谱系(Clade I 和Clade II)。已核实有华南海鱼产品碰触史的6唯病患均集中在其中一个分枝中(Clade I),而Clade II病患无该碰触史,指引COVID-19禽流感的引发并不局限于华南海鱼产品。
新冠传染病病毒基因核酸进化树
接着,通过对禽流感暴发的不同时间阶段和不同区域病患的新冠传染病病毒基因核酸(截至2020年3同同月)表征特点的比较数据分析,从武汉病症分离的传染病病毒基因核酸中识别了169个碱基改变,其重复出现的突变与已公布的传染病病毒核酸一致,椭圆形现较为稳定的进化过程,指引该传染病病毒可能会在禽流感早期就已适于在人类文明体内中传播者。同时他们找到, 新冠传染病病毒两个谱系的传播者性、传染病病毒和临床平庸等方面无非常大差异,未找到与COVID-19重症病患有非常大关的的传染病病毒表征核酸。
COVID-19病患白血球变化
分析医务人员从临床和免疫学分析找到,COVID-19病患白血球明显减少,尤其是重症病患CD4+和CD8+ T细胞椭圆形非常大开展性下降趋向,且炎性细胞因子IL-6和IL-8明显下降。COVID-19传染病发展严重以往的决定因素主要与病患年龄、基础传染病及白血球减少和关的的细胞因子风暴密切关的,为传染病向重症引发变化的关键因素预警因子。
这一分析结果含意深远,对于促使认清新型冠状传染病病毒的大分子流行病特点、传染病引发发展特性,为重症病患早期诊断和治疗法,以及为药物和疫苗制造提供了重要的参考依据。
此外,分析团队还向中国国家组学原始数据百科全书(The National Omics Data Encyclopedia,NODE) ()、当今世界传染病核酸原始数据库(GISAID)和NCBI的国际核酸原始数据库(SRA)呈交了112个病症的新冠传染病病毒基因核酸高质量核酸原始数据。同时,基础设施也搭建了相当程度传染病大原始数据平台新冠传染病病毒基因核酸原始数据交互式、开源在线数据分析该网站()。国内外科研单位和科学家均可完全共享关的分析原始数据。
原始出处:
Xiaonan Zhang, Yun Tan, Yun Ling, et.al. Viral and host factors related to the clinical outcome of COVID-19. Nature 20 May 2020
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